Las tres cuerdas inferiores de la guitarra flamenca, los "bajos", es decir, la 6ª, 5ª y 4ª, están hechas de hilo de nailon enrollado con alambre de metal fino. La tercera cuerda (Sol) es de filamento de nylon liso o puede ser de hilo de nylon enrollado con filamento de nylon; este último tipo es más grueso y su sonido tiende a tener mayor "sustain", pero se desgasta más rápidamente que el filamento liso. La segunda cuerda puede estar recubierta de nylon, aunque suele ser lisa. La primera cuerda es casi siempre de filamento de nailon liso, pero una o dos marcas ofrecen una primera cuerda recubierta. Algunas marcas de cuerdas de nailon liso tienen una superficie lisa. Otras son ligeramente opacas y más ásperas al tacto por haber sido fresadas para proporcionar una sección transversal perfectamente redonda y una entonación más uniforme.
Tanto las cuerdas normales como las de alta tensión son adecuadas para la guitarra flamenca. Los gustos individuales difieren. A veces puede que le resulte mejor combinar agudos de una tensión con bajos de una tensión diferente para obtener el mejor equilibrio de sonido y acción de su guitarra. Puede elegir entre las excelentes cuerdas de Savarez, Luthier, Hannabach y D'Addario, etc.
Limpiar las cuerdas con un paño después de tocarlas evita el deterioro prematuro por la transpiración. Se puede prolongar la vida de las cuerdas cubiertas si se invierten de un extremo a otro cuando su brillo empieza a desvanecerse. Se pueden lavar las cuerdas para prolongar aún más su vida, pero su recuperación es tan efímera que apenas merece la pena.
Cuando se cambian las cuerdas, es esencial hacerlo de una en una para que la tensión de la caja de resonancia no se afloje durante largos periodos. Sin embargo, es útil aflojar de vez en cuando todas las cuerdas cubiertas (pero no las agudas lisas) durante breves periodos de hasta cinco minutos, y volver a tensarlas después de limpiar las cuerdas con un paño. Este procedimiento devuelve el brillo al sonido.
